Разнообразный и многонациональный штат сотрудников МАГАТЭ состоит из высококлассных специалистов самого разного профиля. В их числе — более 2500 представителей широкого спектра ядерных и смежных дисциплин, экспертные знания которых помогают обеспечивать мирное использование ядерного материала и применение ядерных методов в области устойчивого развития.
Центральные учреждения Агентства расположены в Вене, Австрия, где работает бо́льшая часть сотрудников. У МАГАТЭ есть также региональные бюро в Торонто и Токио, бюро по связи в Нью-Йорке и Женеве, исследовательские лаборатории в Зайберсдорфе, Австрия, и в Монако.
МАГАТЭ предлагает различные механизмы организации трудовой деятельности, отвечающие потребностям разнообразного по составу персонала. К ним относятся гибкий рабочий график, неполный рабочий день и механизмы деления рабочего места. В МАГАТЭ предлагается большой социальный пакет, в который входят оплачиваемый отпуск, отпуск по уходу за детьми, медицинское страхование, пенсионная программа, субсидии на образование, а также другие пособия, определяемые типом контракта.