Так же, как большинство энергетических реакторов, большая часть исследовательских реакторов работает на высокообогащенном уране. Их топливный цикл включает изготовление топлива; его использование в реакторе; временное хранение, переработку или прямое захоронение отработавшего топлива; и обращение с радиоактивными отходами. Он также включает различные этапы, необходимые для перевозки урана, свежего топлива, отработавшего топлива и радиоактивных отходов.
Обращение с отработавшим топливом, а также связанные с ним инфраструктура и расходы являются ключевой проблемой для стран, эксплуатирующих исследовательский реактор, но не имеющих ядерно-энергетической программы или имеющих программу лишь ограниченного масштаба. Особенно важно понимать, как обращаться со стареющими ядерными материалами в рамках хранения отработавшего топлива, и определять устойчивые варианты их захоронения.
МАГАТЭ оказывает государствам-членам поддержку по всем аспектам топливного цикла исследовательских реакторов. Оно помогает им разрабатывать новые типы низкообогащенного уранового топлива исследовательских реакторов, устойчивые решения по поставкам топлива и жизнеспособные варианты обращения с отработавшим топливом. Агентство также оказывает помощь в разработке мишеней из низкообогащенного урана, используемых для производства медицинских радиоизотопов, и в обращении с радиоактивными отходами, образующимися в процессе производства медицинских изотопов.