وغالباً ما تضع المنظمات نظم الإدارة بشكل منعزل، وغالباً ما يؤدي هذا إلى تضارب المتطلبات والأولويات والممارسات. ويهدف نظام الإدارة المتكامل إلى تجنب ذلك من خلال الجمع بين جميع النظم والعمليات في إطار واحد كامل، وهو ما يمكن المنظمة من العمل كوحدة واحدة ذات أهداف موحدة. وهذا يحسن الكفاءة والامتثال التنظيمي، بما يكفل إعطاء مسائل الأمان والأمن أولوية عليا في عملية صنع القرار.
وتضطلع الوكالة بأنشطة عديدة لدعم الدول الأعضاء في إنشاء نظمها الإدارية وتنفيذها وتحسينها لضمان اتسام عمليات تشغيل المرافق النووية بالأمان والأمن والموثوقية والاقتصادية. ويشمل ذلك التعامل الآمن مع المصادر المشعة والخدمات التقنية في مجال الأمان الإشعاعي. وتشمل المساعدة المقدمة من الوكالة حلقات العمل والدورات التدريبية والتعلم الإلكتروني وبعثات الخبراء. ويُولى اهتمام خاص لدعم البلدان التي تشرع في برنامج جديد للقوى النووية أو التي توسِّع نطاق برنامج قائم.